DoE+Bioinformática

El nodo DoE+Bioinformática, liderado por José Manuel Sánchez Santos (Universidad de Salamanca USAL + Centro de Investigación del Cáncer CIC-USAL), está formado por 35 miembros. Sus principales líneas de investigación se centran en el Diseño Óptimo de Experimentos y en el Análisis de Datos en el campo de la Bioestadística y la Bioinformática. Cuenta con integrantes y colaboradores de varias universidades nacionales e internacionales, así como de la Public Health School University of California, de empresas como ENUSA y de centros de investigación biosanitarios como el Centro de Investigación del Cáncer de Salamanca (CIC-USAL-CSIC).

Investigadores que participan en el nodo

Investigador/a principal: José Manuel Sánchez Santos (Universidad de Salamanca)

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Principales líneas de investigación

El nodo DoE+Bioinformática está formado por investigadores repartidos por todo el territorio nacional pero unidos por una trayectoria de colaboración científica de más de 20 años en varias líneas de investigación y destaca por su trabajo multidisciplinar en el desarrollo metodológico y aplicado en ciencias biosanitarias, experimentales y sociales.

Entre las líneas actuales de investigación de este nodo citamos:

  • Diseños factoriales óptimos para modelos de respuesta binaria.

  • Diseños óptimos para modelos de Poisson aplicados a la disciplina de toxicología.

  • Diseños adaptativos con aplicaciones a ensayos clínicos y en estudios de supervivencia.

  • Diseños óptimos de experimentos para modelos exponenciales de tiempos de vida o duración de dispositivos.

  • Diseños óptimos compartimentales para la modelización del cuerpo humano con modelos de retención de partículas radiactivas (colaboración: ENUSA Industrias Avanzadas S.A.).

  • Diseño espacial aplicado a disciplinas como Biología o Biomedicina además de su tradicional aplicación a datos geográficos.

  • Modelos biocinéticos sobre la distribución de contaminantes en el medio ambiente.

  • Análisis multivariante combinado de datos clínicos y datos ómicos complejos.

  • Machine Learning, Active Learning y Deep Learning sobre datos biomédicos.

  • Análisis de supervivencia,  predicción de riesgo y respuesta.

  • Modelización de datos biológicos y biomédicos, modelización biocinética y farmacocinética.

  • Análisis combinado de datos ómicos complejos y datos clínicos con algoritmos desarrollados en R y Bioconductor.

Instituciones presentes en el nodo

Actividades de consulting de bioestadística

  • Actividades de servicio y apoyo en el área de la bioestadística, consultar en http://areaestadistica.uclm.es/oed/consulting.html
  • Asesoramiento a varias empresas en métodos de tratamiento de datos ambientales.
  • Asesoría en Medidas Repetidas con la psicóloga Rosa Melero Cañadas, Hospital Central de Ciudad Real.
  • Centro de Investigación del Cáncer (CiC-IMBCC, USAL/CSIC), centro mixto de la Universidad de Salamanca (USAL) y del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)
  • Colaboración con D. Pedro Juan Villarejo Campos (cirujano del Hospital General de Ciudad Real) en el estudio como valores pronósticos de los niveles de VEGF y VEGF-C en pacientes con cáncer gástrico.
  • Colaboración con el equipo de Francisco Feo Brito de la unidad de alergias del Hospital General de Ciudad Real.
  • Departamento de Medicina Interna, Dermatología y Psiquiatría. Facultad de Medicina. Universidad de La Laguna. Tenerife.
  • ENUSA Industrias Avanzadas S.A. Empresa del sector nuclear con varias instalaciones: Asesoramiento en impacto ambiental, exposición profesional, etc.
  • Instituto Universitario de Bio-Orgánica Antonio González. Universidad de La Laguna.
  • Instituto Universitario de Enfermedades Tropicales y Salud Pública de Canarias.
  • Laboratorio de Fisiología Animal del Dep. de Biología Animal de la Universidad de La Laguna.
  • Numerosas actividades de servicio y apoyo en el área de bioinformática, biología computacional y bioestadística realizados desde el Grupo de Bioinformática del CiC-IMBCC (ver http://bioinfow.dep.usal.es/ ) dirigido por el Dr. Javier De Las Rivas.
  • Planta Experimental de Cultivos Marinos del Centro Oceanográfico de Canarias.
    del Instituto Español de Oceanografía.
  • Servicio de asesoramiento estadístico a Francisco Campos del Departamento de Recursos Naturales de la Universidad Europea Miguel de Cervantes de Valladolid.
  • Wolfram Research (desarrollo del paquete BIOKMOD para el programa Mathematica).
  • Asesoramiento estadístico en tesis doctorales y trabajos de investigación.

Entidades y grupos con los que colabora

Área de Psiquiatría Social y Comunitaria. Departamento de Medicina Interna, Dermatología y Psiquiatría. Facultad de Medicina. Universidad de La Laguna. Tenerife

Bodega Salcedo Balmaseda

Center for Cancer Systems Biology CCSB, DFCI, Harvard University (USA) Dr. Marc Vidal

Centro de Investigación del cáncer de la Universidad de Salamanca (CIC/USAL)

Ciemat

Departamento de Bioestadística de UCLA (Universidad de California, Los Angeles) con el Prof. Wong

Departamento de Biología Animal (Zoología). Universidad de La Laguna. Tenerife

Departamento de Medicina Preventiva y Salud Pública, Universidad de Navarra

Dept. Applied Statistics – Johannes-Kepler University de Linz (Austria)

ENUSA Industrias Avanzadas S.A., (Empresa Nacional del Uranio), con una preocupación constante por la seguridad en sus instalaciones que se refleja en los estudios de retención de radiactividad que han realizado los investigadores del nodo en colaboración con la empresa

Epidemiología, Hospital Alto Deba (Mondragón-Arrasate) Guipuzcoa

European Bioinformatics Institute EBI (UK) Dr. Paul Bertone

Facultad de Medicina. Universidad de La Laguna. Tenerife

Farmacocinetica (Dpt de Farmacologia y tecnogia farmacéutica de la USAL)

Glaxosmithkline

Grupo de investigación de Bioinformática del CNB (CSIC, Madrid)

Grupo de investigación de Bioinformática del CNIO (Madrid)

Grupo de investigación de Bioinformática del TECNUN (UNAV, San Sebastian

Grupo de investigación de Oncología Molecular del CIMA (UNAV, Pamplona)

Grupo de investigación de Tecnología de los Alimentos, Universidad de Castilla-La Mancha

Grupo de Investigación en Acuicultura Y Fisiología Marina (AQUAFISMAR). Universidad de La Laguna e Instituto Español de Oceanografía. Tenerife

Grupo de Investigación en Química y Biotecnología de Productos Naturales (QUIBIONAT). Departamento de Química Orgánica. Universidad de La Laguna. Tenerife

Grupo de investigación Estadística del IOBA (UVA, Valladolid)

Grupos de investigación biomolecular y celular del CiC-IMBCC (CSIC/USAL, Salamanca)

Hospital General de Ciudad Real, SESCAM

Hospital Universitario Nuestra Señora de la Candelaria. Servicio Canario de la Salud. Tenerife

Institute for Molecular Bioscience, Univ. of Queensland (Brisbane, Australia) Dr. Marcel Dinger

Instituto Oceanográfico de Canarias

Instituto Universitario de Bio-Orgánica Antonio González. Universidad de La Laguna. Tenerife

Instituto Universitario de Enfermedades Tropicales y Salud Pública de Canarias

S.A.T. Vinos Coloman 3753

Listado de miembros del nodo

  • José Manuel Sánchez Santos

    Investigador/a principalUniversidad de Salamanca
  • Alberto Berral González

    Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC)
  • Arkaitz Galbete Jiménez

    Universidad Pública de Navarra
  • Blas-Fernando Plo Alastrué

    Universidad de Zaragoza
  • Carlos de la Calle Arroyo

    Escuela de Ingeniería Industrial de Toledo
  • Carlos Javier Pérez González

    Universidad de La Laguna
  • Carmelo Rodríguez Torreblanca

    Universidad de Almería
  • Chiara Tommasi

    University of Milan
  • Elena Sánchez Luis

    Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC)
  • Elvira Delgado Márquez

    Universidad de León
  • Enrique de la Rosa Morón

    Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC)
  • Enrique F. González Dávila

    Universidad de La Laguna
  • Irene García-Camacha Gutiérrez

    Escuela de Ingeniería Industrial de Toledo
  • Irene Mariñas del Collado

    Universidad de Salamanca
  • Isabel María Ortiz Rodríguez

    Universidad de Almería
  • Javier de Las Rivas Sanz

    Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC)
  • Jesús López Fidalgo

    Comité EjecutivoUniversidad de Navarra
  • José Antonio Moler Cuiral

    Universidad Pública de Navarra
  • José Guillermo Sánchez León

    Universidad de SalamancaENUSA Industrias Avanzadas S.A.
  • Juan Manuel Rodríguez Díaz

    Universidad de Salamanca
  • Licesio J. Rodríguez Aragón

    Universidad de Castilla-La Mancha
  • María Jesús Rivas López

    Comité de PrensaUniversidad de Salamanca
  • María Teresa Santos Martín

    Universidad de Salamanca
  • Mariano Amo Salas

    Universidad de Castilla-La Mancha
  • Mercedes Rodríguez Hernández

    Universidad de Castilla-La Mancha
  • Miguel Ángel Martínez González

    Universidad de Navarra
  • Natalia Alonso Moreda

    Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC)
  • Pablo Urruchi Mohino

    Universidad de Navarra
  • Raúl Martín Martín

    Universidad de Castilla-La Mancha
  • Roberto Dorta Guerra

    Comité de ConsultoríaUniversidad de La Laguna
  • Sergio Pozuelo Campos

    Universidad de Castilla-La Mancha
  • Stella Maris Salvatierra Galiano

    Universidad de Navarra
  • Teresa Rodríguez Cano

    Hospital General Universitario de Ciudad Real (HGUCR)
  • Víctor Manuel Casero Alonso

    Comité de WebmastersUniversidad de Castilla-La Mancha
  • Weng Kee Wong

    Public Health School University of California